ABSTRACT
F.1 Units . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 235 F.2 Calculation of membrane coefficients . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 237 F.3 Determining friction coefficient and mesh densities . . . . . . . . . . . . . 238 F.4 Setting up interactions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 238 F.5 Fluid parameters . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 240
To properly set up a simulation, we need to pay attention to the various parameters.
