ABSTRACT

Quantitative Biology: From Molecular to Cellular Systems edited by Michael E. Wall © 2012 CRC Press / Taylor & Francis Group, LLC. ISBN: 978-1-4398-2722-2

5.1 Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 93

5.2 Single-Molecule Fluorescence Spectroscopy . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 95 5.2.1 Fluorescent Probes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .96 5.2.2 Förster-Type Resonance Energy Transfer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 97 5.2.3 Single-Molecule Microscopy . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 97 5.2.4 Single-Molecule Data Analysis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 99

5.3 Enzyme Conformational Dynamics . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .101 5.3.1 Single-Molecule Enzyme Turnover . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .101 5.3.2 Single-Molecule Studies of Protein Structure . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .103